1、定義不同
本科教育(undergraduate education),高等教育的中級層次。屬聯合國教科文組織《國際教育標準分類》的第三級第一階段(授予大學第一級學位或同等學歷證書)教育。與專科教育、研究生教育構成高等教育內部的 3 個層次,為高等教育的主干部分。
應用型本科指以應用型為辦學定位,而不是以科研為辦學定位的本科院校。應用型本科教育對于滿足中國經濟社會發展,對高層次應用型人才需要以及推進中國高等教育大眾化進程起到了積極的促進作用。

2、包含范圍不同
本科:在我國普通高考當中,本科錄取分為本科一批(一本)、本科二批(二本)和本科三批(三本)(2017年部分地區取消本科三批)。
應用型本科:現階段一般包括所有的本科第一批、本科第二批錄取院校。
3、招收對象不同
本科教育主要招收高中畢業生,學制依據不同專業,一般為4~5年;少量招收專科畢業生,一般要通過專升本考試,學制2年。
“應用型本科”是對新型的本科教育和新層次的高職教育相結合的教育模式的探索,由部分省屬本科院校與國家級示范性高等職業院校、國家大型骨干企業聯合試點培養適應社會經濟發展需求的應用型本科專業人才。
有差別,應用本科的畢業證會注明是應用型本科,而非普通本科,但是應用本科屬于國家統一招生考試的招生范疇,占用國家普通高考招生名額(這里注意區別自考里面的獨立本科)。
應用本科教育屬于較高層次的技術教育,是我國高職教育中的重要組成部分。它是相對于普通本科和高職專科而言的,它既不同于一般四年制的普通本科,也不同于專科層次的高職。
普通本科和應用本科是本科教育的兩種類型,它們的關系應是行發展的。應用本科是高職教育的一個層次,它同一般普通本科相比具有鮮明的技術應用性特征。
在培養規格上,應用本科培養的不是學科型、學術型、研究型人才,而是培養適應生產、建設、管理、服務第一線需要的高等技術應用性人才;在培養模式上,應用本科以適應社會需要為目標,以培養技術應用能力為主線設計學生的知識、能力、素質結構和培養方案,以“應用”為主旨和特征構建課程和教學內容體系,重視學生的技術應用能力的培養。
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